Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CPNE6O95741 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CPNE6O95741 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CPNE6O95741 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms