Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POP4O95707 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POP4O95707 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POP4O95707 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POP4O95707 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POP4O95707 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POP4O95707 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POP4O95707 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
POP4O95707 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POP4O95707 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POP4O95707 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POP4O95707 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
POP4O95707 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POP4O95707 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POP4O95707 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
POP4O95707 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POP4O95707 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POP4O95707 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
POP4O95707 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POP4O95707 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POP4O95707 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POP4O95707 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POP4O95707 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POP4O95707 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POP4O95707 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POP4O95707 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POP4O95707 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POP4O95707 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POP4O95707 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
POP4O95707 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POP4O95707 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POP4O95707 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
POP4O95707 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POP4O95707 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POP4O95707 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
POP4O95707 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP4O95707 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP4O95707 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP4O95707 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP4O95707 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP4O95707 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP4O95707 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP4O95707 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP4O95707 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
POP4O95707 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POP4O95707 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
POP4O95707 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POP4O95707 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
POP4O95707 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POP4O95707 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POP4O95707 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POP4O95707 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
POP4O95707 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POP4O95707 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
POP4O95707 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POP4O95707 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POP4O95707 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POP4O95707 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
POP4O95707 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POP4O95707 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POP4O95707 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POP4O95707 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
POP4O95707 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
POP4O95707 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POP4O95707 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
POP4O95707 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
POP4O95707 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
POP4O95707 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POP4O95707 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POP4O95707 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
POP4O95707 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
POP4O95707 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
POP4O95707 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POP4O95707 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
POP4O95707 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
POP4O95707 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POP4O95707 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
POP4O95707 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POP4O95707 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POP4O95707 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POP4O95707 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POP4O95707 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POP4O95707 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POP4O95707 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POP4O95707 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POP4O95707 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POP4O95707 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POP4O95707 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POP4O95707 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POP4O95707 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POP4O95707 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POP4O95707 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POP4O95707 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POP4O95707 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POP4O95707 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POP4O95707 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POP4O95707 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POP4O95707 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POP4O95707 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POP4O95707 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms