Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TNFRSF6BO95407 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
TNFRSF6BO95407 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TNFRSF6BO95407 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms