Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
RAPGEF3O95398 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RAPGEF3O95398 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RAPGEF3O95398 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
RAPGEF3O95398 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
RAPGEF3O95398 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
RAPGEF3O95398 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RAPGEF3O95398 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RAPGEF3O95398 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RAPGEF3O95398 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RAPGEF3O95398 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RAPGEF3O95398 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
RAPGEF3O95398 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RAPGEF3O95398 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RAPGEF3O95398 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC36.4■■■■□ 3.42
RAPGEF3O95398 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
RAPGEF3O95398 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RAPGEF3O95398 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.38■■■■□ 3.42
RAPGEF3O95398 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RAPGEF3O95398 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
RAPGEF3O95398 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
RAPGEF3O95398 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms