Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GJB5O95377 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB5O95377 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB5O95377 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB5O95377 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB5O95377 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB5O95377 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB5O95377 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB5O95377 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GJB5O95377 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB5O95377 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB5O95377 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB5O95377 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB5O95377 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB5O95377 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GJB5O95377 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB5O95377 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB5O95377 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB5O95377 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB5O95377 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB5O95377 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GJB5O95377 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB5O95377 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB5O95377 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB5O95377 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB5O95377 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GJB5O95377 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB5O95377 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB5O95377 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB5O95377 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB5O95377 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GJB5O95377 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB5O95377 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB5O95377 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB5O95377 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GJB5O95377 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB5O95377 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB5O95377 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB5O95377 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB5O95377 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB5O95377 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GJB5O95377 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB5O95377 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB5O95377 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB5O95377 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB5O95377 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB5O95377 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB5O95377 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB5O95377 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB5O95377 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GJB5O95377 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB5O95377 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB5O95377 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB5O95377 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB5O95377 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB5O95377 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB5O95377 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB5O95377 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GJB5O95377 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB5O95377 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB5O95377 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB5O95377 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB5O95377 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB5O95377 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GJB5O95377 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB5O95377 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB5O95377 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB5O95377 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB5O95377 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GJB5O95377 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB5O95377 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB5O95377 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB5O95377 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB5O95377 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB5O95377 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GJB5O95377 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB5O95377 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB5O95377 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB5O95377 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GJB5O95377 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB5O95377 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB5O95377 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB5O95377 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
GJB5O95377 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB5O95377 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB5O95377 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB5O95377 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB5O95377 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB5O95377 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB5O95377 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB5O95377 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GJB5O95377 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB5O95377 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GJB5O95377 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB5O95377 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB5O95377 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB5O95377 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB5O95377 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GJB5O95377 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GJB5O95377 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms