Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
KIF4AO95239 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
KIF4AO95239 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
KIF4AO95239 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.6 ms