Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM63AO94886 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM63AO94886 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 185.7 ms