Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC24DO94855 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC24DO94855 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC24DO94855 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms