Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN5O94779 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN5O94779 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN5O94779 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN5O94779 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CNTN5O94779 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN5O94779 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN5O94779 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN5O94779 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CNTN5O94779 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNTN5O94779 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CNTN5O94779 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CNTN5O94779 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms