Protein–RNA interactions for Protein: O76070

SNCG, Gamma-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCGO76070 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCGO76070 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCGO76070 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCGO76070 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCGO76070 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCGO76070 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCGO76070 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCGO76070 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SNCGO76070 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCGO76070 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCGO76070 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCGO76070 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCGO76070 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCGO76070 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCGO76070 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCGO76070 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCGO76070 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCGO76070 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCGO76070 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCGO76070 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCGO76070 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SNCGO76070 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCGO76070 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCGO76070 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCGO76070 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCGO76070 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCGO76070 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCGO76070 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNCGO76070 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNCGO76070 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCGO76070 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCGO76070 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCGO76070 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCGO76070 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCGO76070 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCGO76070 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCGO76070 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCGO76070 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCGO76070 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCGO76070 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNCGO76070 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCGO76070 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNCGO76070 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCGO76070 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCGO76070 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNCGO76070 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCGO76070 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCGO76070 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCGO76070 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNCGO76070 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCGO76070 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCGO76070 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCGO76070 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCGO76070 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCGO76070 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCGO76070 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCGO76070 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCGO76070 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNCGO76070 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCGO76070 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCGO76070 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCGO76070 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCGO76070 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCGO76070 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCGO76070 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCGO76070 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCGO76070 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCGO76070 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCGO76070 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCGO76070 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNCGO76070 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCGO76070 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCGO76070 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCGO76070 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCGO76070 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCGO76070 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCGO76070 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCGO76070 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCGO76070 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCGO76070 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNCGO76070 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCGO76070 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCGO76070 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCGO76070 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCGO76070 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNCGO76070 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNCGO76070 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNCGO76070 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNCGO76070 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCGO76070 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCGO76070 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCGO76070 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCGO76070 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCGO76070 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCGO76070 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCGO76070 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCGO76070 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNCGO76070 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCGO76070 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SNCGO76070 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms