Protein–RNA interactions for Protein: O76011

KRT34, Keratin, type I cuticular Ha4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT34O76011 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KRT34O76011 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT34O76011 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT34O76011 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT34O76011 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT34O76011 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT34O76011 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT34O76011 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT34O76011 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT34O76011 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT34O76011 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT34O76011 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT34O76011 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KRT34O76011 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT34O76011 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT34O76011 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT34O76011 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT34O76011 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT34O76011 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT34O76011 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KRT34O76011 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT34O76011 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KRT34O76011 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT34O76011 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT34O76011 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KRT34O76011 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT34O76011 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT34O76011 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT34O76011 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KRT34O76011 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT34O76011 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT34O76011 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT34O76011 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT34O76011 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
KRT34O76011 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT34O76011 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT34O76011 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT34O76011 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT34O76011 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT34O76011 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
KRT34O76011 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT34O76011 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT34O76011 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT34O76011 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT34O76011 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT34O76011 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT34O76011 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT34O76011 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT34O76011 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
KRT34O76011 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT34O76011 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT34O76011 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT34O76011 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT34O76011 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT34O76011 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT34O76011 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT34O76011 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRT34O76011 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT34O76011 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT34O76011 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT34O76011 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT34O76011 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT34O76011 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KRT34O76011 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT34O76011 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT34O76011 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT34O76011 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
KRT34O76011 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT34O76011 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT34O76011 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT34O76011 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT34O76011 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT34O76011 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT34O76011 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT34O76011 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT34O76011 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT34O76011 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT34O76011 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRT34O76011 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT34O76011 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT34O76011 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT34O76011 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT34O76011 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT34O76011 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT34O76011 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KRT34O76011 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT34O76011 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT34O76011 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT34O76011 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT34O76011 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT34O76011 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT34O76011 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT34O76011 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT34O76011 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT34O76011 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KRT34O76011 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT34O76011 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT34O76011 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KRT34O76011 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KRT34O76011 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms