Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF40O75150 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF40O75150 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF40O75150 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF40O75150 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF40O75150 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF40O75150 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF40O75150 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF40O75150 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF40O75150 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RNF40O75150 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF40O75150 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF40O75150 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF40O75150 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF40O75150 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF40O75150 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF40O75150 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF40O75150 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF40O75150 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RNF40O75150 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF40O75150 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF40O75150 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF40O75150 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF40O75150 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF40O75150 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RNF40O75150 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF40O75150 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF40O75150 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF40O75150 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF40O75150 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RNF40O75150 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF40O75150 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF40O75150 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF40O75150 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF40O75150 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF40O75150 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RNF40O75150 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RNF40O75150 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF40O75150 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF40O75150 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF40O75150 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF40O75150 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RNF40O75150 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF40O75150 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF40O75150 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF40O75150 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF40O75150 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF40O75150 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF40O75150 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF40O75150 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RNF40O75150 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF40O75150 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF40O75150 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF40O75150 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF40O75150 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF40O75150 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF40O75150 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF40O75150 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RNF40O75150 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF40O75150 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF40O75150 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF40O75150 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF40O75150 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF40O75150 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF40O75150 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF40O75150 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF40O75150 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF40O75150 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF40O75150 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF40O75150 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF40O75150 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF40O75150 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF40O75150 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RNF40O75150 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF40O75150 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF40O75150 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF40O75150 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF40O75150 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF40O75150 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF40O75150 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RNF40O75150 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF40O75150 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF40O75150 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF40O75150 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF40O75150 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF40O75150 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF40O75150 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF40O75150 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF40O75150 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RNF40O75150 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF40O75150 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF40O75150 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF40O75150 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF40O75150 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF40O75150 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF40O75150 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF40O75150 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF40O75150 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RNF40O75150 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RNF40O75150 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms