Protein–RNA interactions for Protein: O75074

LRP3, Low-density lipoprotein receptor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP3O75074 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP3O75074 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP3O75074 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP3O75074 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP3O75074 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP3O75074 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LRP3O75074 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP3O75074 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP3O75074 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP3O75074 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP3O75074 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRP3O75074 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP3O75074 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP3O75074 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP3O75074 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP3O75074 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP3O75074 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP3O75074 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP3O75074 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRP3O75074 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP3O75074 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP3O75074 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRP3O75074 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP3O75074 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP3O75074 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP3O75074 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP3O75074 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP3O75074 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP3O75074 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP3O75074 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP3O75074 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP3O75074 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRP3O75074 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP3O75074 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP3O75074 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP3O75074 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP3O75074 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LRP3O75074 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP3O75074 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP3O75074 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP3O75074 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP3O75074 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP3O75074 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LRP3O75074 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP3O75074 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP3O75074 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP3O75074 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP3O75074 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP3O75074 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP3O75074 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP3O75074 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP3O75074 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP3O75074 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP3O75074 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LRP3O75074 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LRP3O75074 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP3O75074 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP3O75074 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP3O75074 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP3O75074 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LRP3O75074 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP3O75074 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP3O75074 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP3O75074 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LRP3O75074 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP3O75074 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP3O75074 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP3O75074 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LRP3O75074 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP3O75074 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP3O75074 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP3O75074 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP3O75074 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP3O75074 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP3O75074 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LRP3O75074 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP3O75074 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP3O75074 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP3O75074 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP3O75074 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP3O75074 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP3O75074 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP3O75074 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP3O75074 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LRP3O75074 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP3O75074 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP3O75074 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP3O75074 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP3O75074 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP3O75074 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LRP3O75074 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LRP3O75074 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LRP3O75074 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP3O75074 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP3O75074 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP3O75074 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP3O75074 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP3O75074 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP3O75074 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LRP3O75074 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms