Protein–RNA interactions for Protein: O60423

ATP8B3, Phospholipid-transporting ATPase IK, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B3O60423 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP8B3O60423 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ATP8B3O60423 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATP8B3O60423 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms