Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NOBOXO60393 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NOBOXO60393 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NOBOXO60393 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms