Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CACNG3O60359 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CACNG3O60359 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CACNG3O60359 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CACNG3O60359 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms