Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
VEGFDO43915 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VEGFDO43915 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VEGFDO43915 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms