Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KIF1CO43896 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
KIF1CO43896 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIF1CO43896 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms