Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SSNA1O43805 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SSNA1O43805 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SSNA1O43805 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms