Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA2O43364 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA2O43364 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA2O43364 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA2O43364 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA2O43364 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA2O43364 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA2O43364 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA2O43364 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA2O43364 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA2O43364 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA2O43364 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA2O43364 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA2O43364 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA2O43364 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA2O43364 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms