Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GPAA1O43292 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GPAA1O43292 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GPAA1O43292 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GPAA1O43292 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.1 ms