Protein–RNA interactions for Protein: O14730

RIOK3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK3O14730 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIOK3O14730 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIOK3O14730 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIOK3O14730 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms