Protein–RNA interactions for Protein: O14715

RGPD8, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD8O14715 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
RGPD8O14715 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RGPD8O14715 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
RGPD8O14715 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD8O14715 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD8O14715 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD8O14715 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD8O14715 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD8O14715 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
RGPD8O14715 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGPD8O14715 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGPD8O14715 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGPD8O14715 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGPD8O14715 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
RGPD8O14715 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
RGPD8O14715 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
RGPD8O14715 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
RGPD8O14715 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RGPD8O14715 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RGPD8O14715 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RGPD8O14715 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RGPD8O14715 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RGPD8O14715 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RGPD8O14715 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RGPD8O14715 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
RGPD8O14715 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RGPD8O14715 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RGPD8O14715 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
RGPD8O14715 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
RGPD8O14715 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
RGPD8O14715 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RGPD8O14715 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RGPD8O14715 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RGPD8O14715 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RGPD8O14715 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RGPD8O14715 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
RGPD8O14715 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RGPD8O14715 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RGPD8O14715 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
RGPD8O14715 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RGPD8O14715 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RGPD8O14715 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
RGPD8O14715 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RGPD8O14715 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
RGPD8O14715 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
RGPD8O14715 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.3 ms