Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC41.65■■■■■ 4.26
CUX2O14529 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
CUX2O14529 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
CUX2O14529 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
CUX2O14529 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
CUX2O14529 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
CUX2O14529 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
CUX2O14529 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
CUX2O14529 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
CUX2O14529 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CUX2O14529 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
CUX2O14529 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC41.59■■■■■ 4.25
CUX2O14529 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
CUX2O14529 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
CUX2O14529 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CUX2O14529 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
CUX2O14529 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
CUX2O14529 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC41.57■■■■■ 4.25
CUX2O14529 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
CUX2O14529 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CUX2O14529 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
CUX2O14529 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CUX2O14529 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CUX2O14529 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
CUX2O14529 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
CUX2O14529 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CUX2O14529 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC41.54■■■■■ 4.24
CUX2O14529 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CUX2O14529 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CUX2O14529 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CUX2O14529 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CUX2O14529 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CUX2O14529 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
CUX2O14529 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
CUX2O14529 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
CUX2O14529 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
CUX2O14529 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
CUX2O14529 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC41.51■■■■■ 4.23
CUX2O14529 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
CUX2O14529 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CUX2O14529 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
CUX2O14529 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CUX2O14529 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
CUX2O14529 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
CUX2O14529 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CUX2O14529 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CUX2O14529 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CUX2O14529 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CUX2O14529 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CUX2O14529 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
CUX2O14529 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC41.47■■■■■ 4.23
CUX2O14529 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
CUX2O14529 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CUX2O14529 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
CUX2O14529 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC41.46■■■■■ 4.23
CUX2O14529 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CUX2O14529 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CUX2O14529 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
CUX2O14529 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC41.44■■■■■ 4.22
CUX2O14529 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CUX2O14529 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
CUX2O14529 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC41.42■■■■■ 4.22
CUX2O14529 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CUX2O14529 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CUX2O14529 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CUX2O14529 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CUX2O14529 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
CUX2O14529 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
CUX2O14529 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CUX2O14529 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CUX2O14529 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CUX2O14529 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CUX2O14529 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CUX2O14529 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CUX2O14529 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CUX2O14529 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC41.4■■■■■ 4.22
CUX2O14529 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CUX2O14529 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CUX2O14529 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CUX2O14529 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CUX2O14529 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
CUX2O14529 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
CUX2O14529 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.22
CUX2O14529 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
CUX2O14529 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
CUX2O14529 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC41.38■■■■■ 4.21
CUX2O14529 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CUX2O14529 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CUX2O14529 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC41.36■■■■■ 4.21
CUX2O14529 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
CUX2O14529 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CUX2O14529 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CUX2O14529 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CUX2O14529 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
CUX2O14529 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CUX2O14529 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CUX2O14529 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CUX2O14529 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CUX2O14529 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CUX2O14529 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC41.34■■■■■ 4.21
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