Protein–RNA interactions for Protein: O00337

SLC28A1, Sodium/nucleoside cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A1O00337 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLC28A1O00337 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SLC28A1O00337 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms