Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SNAP23O00161 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SNAP23O00161 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SNAP23O00161 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SNAP23O00161 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms