Protein–RNA interactions for Protein: K7EJ46

SMIM22, Small integral membrane protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM22K7EJ46 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMIM22K7EJ46 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMIM22K7EJ46 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMIM22K7EJ46 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMIM22K7EJ46 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms