Protein–RNA interactions for Protein: H7C423

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C423 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C423 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C423 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
H7C423 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C423 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C423 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C423 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C423 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C423 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C423 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C423 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C423 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C423 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C423 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C423 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C423 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C423 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C423 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C423 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H7C423 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H7C423 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H7C423 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H7C423 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H7C423 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H7C423 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
H7C423 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H7C423 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
H7C423 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H7C423 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C423 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C423 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C423 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C423 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C423 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C423 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C423 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C423 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C423 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C423 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C423 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C423 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C423 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H7C423 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C423 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C423 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C423 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C423 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C423 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C423 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C423 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C423 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H7C423 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C423 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C423 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C423 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C423 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C423 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C423 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C423 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C423 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C423 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C423 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H7C423 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C423 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C423 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C423 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C423 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C423 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C423 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C423 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C423 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C423 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C423 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C423 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H7C423 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C423 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C423 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C423 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C423 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C423 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C423 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C423 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C423 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C423 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C423 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C423 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C423 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C423 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C423 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C423 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C423 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
H7C423 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H7C423 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H7C423 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H7C423 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H7C423 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
H7C423 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H7C423 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H7C423 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H7C423 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms