Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NPIPA5E9PKD4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NPIPA5E9PKD4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NPIPA5E9PKD4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms