Protein–RNA interactions for Protein: B7U540

KCNJ18, Inward rectifier potassium channel 18, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ18B7U540 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNJ18B7U540 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNJ18B7U540 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNJ18B7U540 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KCNJ18B7U540 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNJ18B7U540 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNJ18B7U540 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNJ18B7U540 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNJ18B7U540 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KCNJ18B7U540 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNJ18B7U540 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNJ18B7U540 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNJ18B7U540 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNJ18B7U540 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNJ18B7U540 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNJ18B7U540 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNJ18B7U540 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNJ18B7U540 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNJ18B7U540 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNJ18B7U540 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KCNJ18B7U540 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KCNJ18B7U540 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
KCNJ18B7U540 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.8 ms