Protein–RNA interactions for Protein: B3KWA1

IDS, Iduronate 2-sulfatase (Hunter syndrome), isoform CRA_e, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDSB3KWA1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IDSB3KWA1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IDSB3KWA1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IDSB3KWA1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms