Protein–RNA interactions for Protein: A6NNA5

DRGX, Dorsal root ganglia homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DRGXA6NNA5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
DRGXA6NNA5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DRGXA6NNA5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DRGXA6NNA5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms