Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM200CA6NKL6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TMEM200CA6NKL6 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM200CA6NKL6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms