Protein–RNA interactions for Protein: A6NHC0

CAPN8, Calpain-8, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN8A6NHC0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPN8A6NHC0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CAPN8A6NHC0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CAPN8A6NHC0 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CAPN8A6NHC0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms