Protein–RNA interactions for Protein: A2RUT3

TMEM89, Transmembrane protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM89A2RUT3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM89A2RUT3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM89A2RUT3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM89A2RUT3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM89A2RUT3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM89A2RUT3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM89A2RUT3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM89A2RUT3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM89A2RUT3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM89A2RUT3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMEM89A2RUT3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TMEM89A2RUT3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TMEM89A2RUT3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms