Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
E2F8A0AVK6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
E2F8A0AVK6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
E2F8A0AVK6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms