Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X0T9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X0T9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
A0A087X0T9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
A0A087X0T9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087X0T9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087X0T9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087X0T9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087X0T9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087X0T9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087X0T9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
A0A087X0T9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087X0T9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087X0T9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087X0T9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087X0T9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
A0A087X0T9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
A0A087X0T9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms