Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SNX13Q9Y5W8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SNX13Q9Y5W8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SNX13Q9Y5W8 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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SNX13Q9Y5W8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
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SNX13Q9Y5W8 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SNX13Q9Y5W8 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
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