Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TPRKBQ9Y3C4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TPRKBQ9Y3C4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TPRKBQ9Y3C4 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TPRKBQ9Y3C4 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TPRKBQ9Y3C4 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
TPRKBQ9Y3C4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TPRKBQ9Y3C4 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TPRKBQ9Y3C4 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms