Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DTX4Q9Y2E6 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms