Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL63

MKLN1, Muskelin, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKLN1Q9UL63 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MKLN1Q9UL63 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms