Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM5BQ9UGL1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM5BQ9UGL1 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms