Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DKK4Q9UBT3 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms