Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LIN28AQ9H9Z2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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