Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CIPCQ9C0C6 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
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