Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms