Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MVB12AQ96EY5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MVB12AQ96EY5 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms