Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX3

ZNF501, Zinc finger protein 501, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF501Q96CX3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
ZNF501Q96CX3 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms