Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
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CHTF18Q8WVB6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CHTF18Q8WVB6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CHTF18Q8WVB6 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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CHTF18Q8WVB6 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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CHTF18Q8WVB6 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHTF18Q8WVB6 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms