Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NLRP13Q86W25 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms